Digestion : Les enzymes libérés par les micro-organismes du microbiote aident l'animal à digérer certains aliments non digestibles.
Comportement : Les microbiotes du tube digestif "dialoguent" avec le cerveau, influant sur le comportement et l'état d'anxiété de l'hôte.
Appétit : En stimulant le système nerveux, le microbiote intestinal aide à l'appétit, l'envie de manger et la satiété.
Fonctionnement de l'intestin : Les micro-organismes du microbiote aident au fonctionnement de l'intestin.
Agent protecteur : Le microbiote agit comme barrière et agent protecteur, empêchant certains microbes pathogènes de s'installer et de proliférer dans l'intestin.
Système immunitaire : La présence de ces micro-organismes aide le système immunitaire à se développer de façon normale et régulière tout au long de la vie de l'animal.